VPS45

Ідентифікатори

Символи

VPS45, H1, H1SCN5, VPS45A, VPS45B, VPS54A, VSP45, VSP45A, vacuolar protein sorting 45 homolog

Зовнішні ІД

OMIM: 610035 MGI: 891965 HomoloGene: 5250 GeneCards: VPS45

Пов'язані генетичні захворювання

VPS45^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція
Клітинна компонента	• integral component of membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • endosome membrane • мембрана • Golgi membrane • компонент клітини • Синаптичні бульбашки
Біологічний процес	• protein transport • intracellular protein transport • зсідання крові • vesicle-mediated transport • vesicle docking involved in exocytosis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11311


22365

Ensembl


ENSG00000136631


ENSMUSG00000015747

UniProt


Q9NRW7


P97390

RefSeq (мРНК)


NM_001279353 NM_001279354 NM_001279355 NM_007259


NM_013841

RefSeq (білок)


NP_001266282 NP_001266283 NP_009190


NP_038869

Локус (UCSC)

Хр. 1: 150.07 – 150.15 Mb

Хр. 3: 95.91 – 95.97 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VPS45 (англ. Vacuolar protein sorting 45 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 570 амінокислот, а молекулярна маса — 65 077^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNVVFAVKQY	ISKMIEDSGP	GMKVLLMDKE	TTGIVSMVYT	QSEILQKEVY
LFERIDSQNR	EIMKHLKAIC	FLRPTKENVD	YIIQELRRPK	YTIYFIYFSN
VISKSDVKSL	AEADEQEVVA	EVQEFYGDYI	AVNPHLFSLN	ILGCCQGRNW
DPAQLSRTTQ	GLTALLLSLK	KCPMIRYQLS	SEAAKRLAEC	VKQVITKEYE
LFEFRRTEVP	PLLLILDRCD	DAITPLLNQW	TYQAMVHELL	GINNNRIDLS
RVPGISKDLR	EVVLSAENDE	FYANNMYLNF	AEIGSNIKNL	MEDFQKKKPK
EQQKLESIAD	MKAFVENYPQ	FKKMSGTVSK	HVTVVGELSR	LVSERNLLEV
SEVEQELACQ	NDHSSALQNI	KRLLQNPKVT	EFDAARLVML	YALHYERHSS
NSLPGLMMDL	RNKGVSEKYR	KLVSAVVEYG	GKRVRGSDLF	SPKDAVAITK
QFLKGLKGVE	NVYTQHQPFL	HETLDHLIKG	RLKENLYPYL	GPSTLRDRPQ
DIIVFVIGGA	TYEEALTVYN	LNRTTPGVRI	VLGGTTVHNT	KSFLEEVLAS
GLHSRSKESS	QVTSRSASRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Локалізований у мембрані, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Pevsner J., Hsu S.-C., Hyde P.S., Scheller R.H. (1996). Mammalian homologues of yeast vacuolar protein sorting (vps) genes implicated in Golgi-to-lysosome trafficking. Gene. 183: 7—14. PMID 8996080 DOI:10.1016/S0378-1119(96)00367-8
Rajasekariah P., Eyre H.J., Stanley K.K., Walls R.S., Sutherland G.R. (1999). Molecular cloning and characterization of a cDNA encoding the human leucocyte vacuolar protein sorting (hlVps45). Int. J. Biochem. Cell Biol. 31: 683—694. PMID 10404641 DOI:10.1016/S1357-2725(99)00017-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
de Renzis S., Soennichsen B., Zerial M. (2002). Divalent Rab effectors regulate the sub-compartmental organization and sorting of early endosomes. Nat. Cell Biol. 4: 124—133. PMID 11788822 DOI:10.1038/ncb744

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з VPS45 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14579 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9NRW7 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.