VPS72

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5FUG

Ідентифікатори

Символи

VPS72, CFL1, Swc2, TCFL1, YL-1, YL1, vacuolar protein sorting 72 homolog

Зовнішні ІД

OMIM: 600607 MGI: 1202305 HomoloGene: 110905 GeneCards: VPS72

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0031493 histone binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • somatic stem cell population maintenance • transcription, DNA-templated • GO:0035042 histone exchange • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6944


21427

Ensembl


ENSG00000163159


ENSMUSG00000008958

UniProt


Q15906


Q62481

RefSeq (мРНК)


NM_005997 NM_001271087 NM_001271088


NM_009336

RefSeq (білок)


NP_001258016 NP_001258017 NP_005988


NP_033362

Локус (UCSC)

Хр. 1: 151.18 – 151.2 Mb

Хр. 3: 95.02 – 95.03 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VPS72 (англ. Vacuolar protein sorting 72 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 364 амінокислот, а молекулярна маса — 40 594^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLAGGRAPR	KTAGNRLSGL	LEAEEEDEFY	QTTYGGFTEE	SGDDEYQGDQ
SDTEDEVDSD	FDIDEGDEPS	SDGEAEEPRR	KRRVVTKAYK	EPLKSLRPRK
VNTPAGSSQK	AREEKALLPL	ELQDDGSDSR	KSMRQSTAEH	TRQTFLRVQE
RQGQSRRRKG	PHCERPLTQE	ELLREAKITE	ELNLRSLETY	ERLEADKKKQ
VHKKRKCPGP	IITYHSVTVP	LVGEPGPKEE	NVDIEGLDPA	PSVSALTPHA
GTGPVNPPAR	CSRTFITFSD	DATFEEWFPQ	GRPPKVPVRE	VCPVTHRPAL
YRDPVTDIPY	ATARAFKIIR	EAYKKYITAH	GLPPTASALG	PGPPPPEPLP
GSGPRALRQK	IVIK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Horikawa I., Tanaka H., Yuasa Y., Suzuki M., Oshimura M. (1995). Molecular cloning of a novel human cDNA on chromosome 1q21 and its mouse homolog encoding a nuclear protein with DNA-binding ability. Biochem. Biophys. Res. Commun. 208: 999—1007. PMID 7702631 DOI:10.1006/bbrc.1995.1433
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Doyon Y., Selleck W., Lane W.S., Tan S., Cote J. (2004). Structural and functional conservation of the NuA4 histone acetyltransferase complex from yeast to humans. Mol. Cell. Biol. 24: 1884—1896. PMID 14966270 DOI:10.1128/MCB.24.5.1884-1896.2004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11644 (англ.) . Архів оригіналу за 28 липня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q15906 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.