VRK2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2V62

Ідентифікатори

Символи

VRK2, vaccinia related kinase 2, VRK serine/threonine kinase 2

Зовнішні ІД

OMIM: 602169 MGI: 1917172 HomoloGene: 55966 GeneCards: VRK2

шифр КФ

2.7.11.1

Пов'язані генетичні захворювання

шизофренія^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • protein domain specific binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • protein kinase binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мітохондріальна мембрана • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• regulation of MAPK cascade • regulation of interleukin-1-mediated signaling pathway • фосфорилювання • protein phosphorylation • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • protein autophosphorylation • cellular response to oxidative stress • GO:0022415 viral process • regulation of cell shape • peptidyl-threonine phosphorylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7444


69922

Ensembl


ENSG00000028116


ENSMUSG00000064090

UniProt


Q86Y07


Q8BN21

RefSeq (мРНК)

NM_001130480 NM_001130481 NM_001130482 NM_001130483 NM_001288836
NM_001288837 NM_001288838 NM_001288839 NM_006296


NM_001252447 NM_027260

RefSeq (білок)

NP_001123952 NP_001123953 NP_001123954 NP_001123955 NP_001275765
NP_001275766 NP_001275767 NP_001275768 NP_006287


NP_001239376 NP_081536

Локус (UCSC)

Хр. 2: 57.91 – 58.16 Mb

Хр. 11: 26.42 – 26.54 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VRK2 (англ. Vaccinia related kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 58 141^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPPKRNEKYK	LPIPFPEGKV	LDDMEGNQWV	LGKKIGSGGF	GLIYLAFPTN
KPEKDARHVV	KVEYQENGPL	FSELKFYQRV	AKKDCIKKWI	ERKQLDYLGI
PLFYGSGLTE	FKGRSYRFMV	MERLGIDLQK	ISGQNGTFKK	STVLQLGIRM
LDVLEYIHEN	EYVHGDIKAA	NLLLGYKNPD	QVYLADYGLS	YRYCPNGNHK
QYQENPRKGH	NGTIEFTSLD	AHKGVALSRR	SDVEILGYCM	LRWLCGKLPW
EQNLKDPVAV	QTAKTNLLDE	LPQSVLKWAP	SGSSCCEIAQ	FLVCAHSLAY
DEKPNYQALK	KILNPHGIPL	GPLDFSTKGQ	SINVHTPNSQ	KVDSQKAATK
QVNKAHNRLI	EKKVHSERSA	ESCATWKVQK	EEKLIGLMNN	EAAQESTRRR
QKYQESQEPL	NEVNSFPQKI	SYTQFPNSFY	EPHQDFTSPD	IFKKSRSPSW
YKYTSTVSTG	ITDLESSTGL	WPTISQFTLS	EETNADVYYY	RIIIPVLLML
VFLALFFL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Nezu J., Oku A., Jones M.H., Shimane M. (1997). Identification of two novel human putative serine/threonine kinases, VRK1 and VRK2, with structural similarity to Vaccinia virus B1R kinase. Genomics. 45: 327—331. PMID 9344656 DOI:10.1006/geno.1997.4938
Blanco S., Klimcakova L., Vega F.M., Lazo P.A. (2006). The subcellular localization of vaccinia-related kinase-2 (VRK2) isoforms determines their different effect on p53 stability in tumour cell lines. FEBS J. 273: 2487—2504. PMID 16704422 DOI:10.1111/j.1742-4658.2006.05256.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nichols R.J., Traktman P. (2004). Characterization of three paralogous members of the Mammalian vaccinia related kinase family. J. Biol. Chem. 279: 7934—7946. PMID 14645249 DOI:10.1074/jbc.M310813200
Li L.Y., Liu M.Y., Shih H.M., Tsai C.H., Chen J.Y. (2006). Human cellular protein VRK2 interacts specifically with Epstein-Barr virus BHRF1, a homologue of Bcl-2, and enhances cell survival. J. Gen. Virol. 87: 2869—2878. PMID 16963744 DOI:10.1099/vir.0.81953-0
Nichols R.J., Wiebe M.S., Traktman P. (2006). The vaccinia-related kinases phosphorylate the N' terminus of BAF, regulating its interaction with DNA and its retention in the nucleus. Mol. Biol. Cell. 17: 2451—2464. PMID 16495336 DOI:10.1091/mbc.E05-12-1179

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з VRK2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12719 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q86Y07 (англ.) . Архів оригіналу за 2 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.