黃鼠冠狀病毒HKU24 |
病毒分類 |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
门: | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
纲: | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠状病毒科 Coronaviridae |
属: | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
种: | 黃鼠冠狀病毒HKU24 China Rattus Coronavirus HKU24 |
中國鼠冠狀病毒HKU24(China Rattus Coronavirus HKU24、ChRCoVHKU24)是乙型冠狀病毒屬的一種病毒,在香港與廣州的大鼠腸道中被發現,於2015年由香港大學的研究人員發表[1]。
基因組
中國鼠冠狀病毒HKU24的基因組約長31200nt,編碼冠狀病毒皆有的複製酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)與衣殼蛋白(N)等四種結構蛋白,另外還有血細胞凝集素酯酶(英语:Hemagglutinin esterase)(HE)以及NS2a、NS4、NS5與N2等四種輔助蛋白,其基因順序為1ab-NS2-HE-S-NS4-NS5-E-M-N2-N[1]。
演化
序列分析顯示中國鼠冠狀病毒HKU24在乙型冠狀病毒1型(牛冠狀病毒、人類冠狀病毒OC43、豬凝血性腦脊髓炎病毒等)的基部形成一演化支,顯示此病毒可能是乙型冠狀病毒1型(包含兔冠狀病毒HKU14)的姊妹群,和同亞屬中亦感染鼠類的鼠冠狀病毒則關係較遠。此病毒的演化地位顯示可感染多種動物的乙型冠狀病毒1型最早可能是由鼠類病毒演化而來。此病毒與乙型冠狀病毒1型、鼠冠狀病毒、人類冠狀病毒HKU1等共同組成一演化支支序A(lineage A),此演化支的病毒基因組中皆編碼血细胞凝集素酯酶(HE),其他冠狀病毒則無[1][2]。
參見
參考文獻
- ^ 1.0 1.1 1.2 Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian. Sandri-Goldin, R. M. , 编. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015-03-15, 89 (6): 3076–3092 [2022-01-27]. ISSN 0022-538X. PMC 4337523 . PMID 25552712. doi:10.1128/JVI.02420-14. (原始内容存档于2022-05-13) (英语).
- ^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820 [2022-01-27]. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. (原始内容存档于2022-05-07) (英语).
In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).
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| 甲型冠狀病毒屬 (α-CoV) | | | |
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| NL63病毒 | 人類冠狀病毒NL63(HCoV-NL63) · NL63相關蝙蝠冠狀病毒(英语:NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b) |
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| 其他 | |
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| 乙型冠狀病毒屬 (β-CoV) | Embecovirus(英语:Embecovirus) (支系A) | | |
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| | 鼠冠狀病毒(M-CoV) | 鼠肝炎病毒(MHV) · 大鼠冠狀病毒(RCoV)(大鼠涎淚腺炎病毒SDAV · 帕克RCoV) |
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| | Merbecovirus(英语:Merbecovirus) (支系C) | |
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| | Nobecovirus(英语:Nobecovirus)(支系D) | |
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| 丙型冠状病毒属 (γ-CoV) | Cegacovirus | 鯨豚冠狀病毒(白鯨冠狀病毒SW1 · 瓶鼻海豚冠狀病毒HKU22) |
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| | Brangacovirus(英语:Brangacovirus) | |
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| Igacovirus(英语:Igacovirus) | |
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| 丁型冠狀病毒屬 (δ-CoV) | 鵯冠狀病毒HKU11(BuCoV HKU11) · 鶇冠狀病毒HKU12(ThCoV HKU12) · 文鳥冠狀病毒HKU13(英语:Munia coronavirus HKU13)(MuCoV HKU13) · 猪丁型冠状病毒(PdCV) · 繡眼冠狀病毒HKU16(英语:White-eye coronavirus HKU16)(WeCoV HKU16) · 麻雀冠狀病毒HKU17(SpCoV HKU17) · 鵲鴝冠狀病毒HKU18(MRCoV HKU18) · 夜鷺冠狀病毒HKU19 · 鴨冠狀病毒HKU20(WiCoV HKU20) · 紅冠水雞冠狀病毒HKU21(英语:Common moorhen coronavirus HKU21)(CMCoV HKU21) · 隼冠狀病毒HKU27(FalCoV UAE-HKU27) · 翎頜鴇冠狀病毒HKU28(HouCoV UAE-HKU28) · 鴿冠狀病毒HKU29(PiCoV UAE-HKU29) · 鵪鶉冠狀病毒HKU30(QuaCoV UAE-HKU30) |
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