{{{Name}}} |
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识别码 |
EC編號 | 3.6.5.3 |
数据库 |
IntEnz | IntEnz浏览 |
BRENDA(英语:BRENDA) | BRENDA入口 |
ExPASy(英语:ExPASy) | NiceZyme浏览 |
KEGG | KEGG入口 |
MetaCyc(英语:MetaCyc) | 代谢路径 |
PRIAM(英语:PRIAM_enzyme-specific_profiles) | 概述 |
PDB | RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum |
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Translation elongation factor EFG/EF2 |
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鑑定 |
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標誌 | Transl_elong_EFG/EF2 |
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InterPro(英语:InterPro) | IPR004540 |
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SCOP(英语:Structural Classification of Proteins) | 1n0u / SUPFAM |
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EFG/EF2, domain IV |
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鑑定 |
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標誌 | EFG_IV |
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Pfam | PF03764(旧版) |
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Pfam宗系 | CL0329(旧版) |
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SMART(英语:Simple Modular Architecture Research Tool) | SM00889 |
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CDD(英语:Conserved Domain Database) | cd01434 |
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現有可用的蛋白結構: |
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Pfam | 結構(旧版) / ECOD |
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PDB | RCSB PDB; PDBe; PDBj |
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PDBsum(英语:PDBsum) | 結構概要 |
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延伸因子G(Elongation Factor G),簡稱EF-G,又稱EF-2,曾被稱爲轉位酶(translocase),是一種原核延伸因子,具有GTP酶活性。現認爲EF-G的GTP酶活性與tRNA和mRNA穿過核糖體的協同移動有關[1]。
功能
EF-G在每一輪多肽鏈延長的結束階段催化tRNA和mRNA的轉位到核糖體的下游[1]。和EF-Tu*tRNA*GTP三元複合物相似,EF-G與核糖體結合時處於與GTP結合的狀態。
除了在翻译中的作用外,EF-G还与核糖体再循环因子(英语:Ribosome Recycling Factor)一起以GTP依赖方式促进核糖体再循环[2]。
临床应用
一般来说,EF-G的功能可被夫西地酸抑制,但已检出某些细菌对夫西地酸的抗药性[3][4]。
進化
EF-G的進化歷程複雜,細菌有很多EF-G的旁系變體,說明不同的EF-G變體可能發生了亚功能化(英语:subfunctionalization)[5]。
參考
- ^ 1.0 1.1 Shoji, S; Walker, SE; Fredrick, K. Ribosomal translocation: one step closer to the molecular mechanism. ACS Chem Biol. 2009, 4: 93–107. PMID 19173642. doi:10.1021/cb8002946.
- ^ Zavialov AV, Hauryliuk VV, Ehrenberg M. Splitting of the posttermination ribosome into subunits by the concerted action of RRF and EF-G. Molecular Cell. 2005, 18 (6): 675–686. PMID 15949442. doi:10.1016/j.molcel.2005.05.016.
- ^ Macvanin M, Hughes D. Hyper-susceptibility of a fusidic acid-resistant mutant of Salmonella to different classes of antibiotics. FEMS microbiology letters. June 2005, 247 (2): 215–20 [2014-02-03]. PMID 15935566. doi:10.1016/j.femsle.2005.05.007. (原始内容存档于2018-04-10).
- ^ Macvanin M, Johanson U, Ehrenberg M, Hughes D. Fusidic acid-resistant EF-G perturbs the accumulation of ppGpp. Molecular Microbiology. July 2000, 37 (1): 98–107. PMID 10931308. doi:10.1046/j.1365-2958.2000.01967.x. [永久失效連結]
- ^ G C Atkinson; S L Baldauf. Evolution of elongation factor G and the origins of mitochondrial and chloroplast forms. Molecular Biology and Evolution. 2011, 28 (3): 1281–92. PMID 21097998. doi:10.1093/molbev/msq316.
外部連結
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| 基本概念 | |
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| 核糖体蛋白质 | | | PIF1 · PIF2 · PIF3 |
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| 古菌起始因子 | aIF1 · aIF2 · aIF5 · aIF6 |
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| | eIF1(AX · AY · 1B) eIF2(S1 · S2 · S3) · B1 · B2 · B3 · B4 · B5 · eIF2激酶 eIF3(A · B · C · D · F · G · H · I · J · K · M · S6) eIF4(eIF4A(A1 · A2 · A3) · B · E1 · E2 · G1 · G2 · G3 · H) eIF5(A · A2 · B) eIF6 |
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| 古菌延伸因子 | aEF1 · aEF2 |
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| | eEF1(A1 · A2 · A3 · B1 · B2 · B3 · B4 · D · E1 · G) · eEF2 |
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| | 原核释放因子 · 古菌释放因子 · 真核释放因子(英语:Eukaryotic release factors) |
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| 其他 | RPS1 · RPS2 · RPS3 · RPS4 · RPS5 · RPS6 · RPS7 · RPS8 · RPS9 · RPS10 · RPS11 · RPS12 · RPS13 · RPS14 · RPS15 · RPS16 · RPS17 · RPS18 · RPS19 · RPS20 · RPS21 · RPS22 · RPS23 · RPS24 · RPS25 · RPS26 · RPS27 · RPS28 · RPS29 |
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| 遗传学索引 |
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| 描述 | - 生化
- 基因表达
- DNA
- 转录
- 转录因子与细胞内受体
- 辅调节因子
- RNA
- 重复序列
- 转录后修饰
- 翻译
- 核糖体亚基
- 翻译后修饰
- 分拣蛋白(英语:Template:Sorting nexin)
- DNA结合蛋白(英语:Template:DNA-binding proteins)/RNA结合蛋白(英语:Template:RNA-binding proteins)
- 蛋白质
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| 疾病 | - Replication and repair(英语:Template:DNA replication and repair-deficiency disorder)
- Transcription factor(英语:Template:Transcription factor and coregulator deficiencies)
- 转录相关疾病(英语:Template:Disorders of transcription and post transcriptional modification)
- 轉譯相關疾病
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| 3.6.1 | - 焦磷酸酶
- 无机焦磷酸酶
- 硫胺素焦磷酸酶(英语:Thiamine pyrophosphatase)
- 三磷酸腺苷双磷酸酶(英语:Apyrase)
- 硫胺素三磷酸酶(英语:Thiamine-triphosphatase)
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| 3.6.2 | - 腺嘌呤硫酸酯酶(英语:Adenylylsulfatase)
- 磷酸腺嘌呤酰基硫酸酯酶(英语:Phosphoadenylylsulfatase)
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| 3.6.3-4: ATP酶 | 3.6.3 | Cu²⁺ (3.6.3.4) | - Menkes/ATP7A
- Wilson/ATP7B
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| Ca²⁺ (3.6.3.8) | - SERCA
- 质膜
- ATP2B1
- ATP2B2
- ATP2B3
- ATP2B4
- SPCA
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| Na+/K+ (3.6.3.9) | - ATP1A1
- ATP1A2
- ATP1A3
- ATP1A4
- ATP1B1
- ATP1B2
- ATP1B3
- ATP1B4
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| H+/K+ (3.6.3.10) | |
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| P型ATP酶 | - ATP8B1
- ATP10A
- ATP11B
- ATP12A
- ATP13A2
- ATP13A3
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| 3.6.4 | |
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| 3.6.5: GTP酶(英语:GTPase) | 3.6.5.1: 异三聚体G蛋白(英语:Heterotrimeric G protein) | - Gαs
- Gαi
- Gαq/11
- Gα12/13
- Transducin
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| 3.6.5.2: 小G蛋白 > Ras超家族 | - Rho family of GTPases: Cdc42
- RhoUV
- Rac
- RhoBTB
- RhoH
- Rho
- Rnd
- RhoDF
- other: Ras
- Rab
- Arf
- Ran
- Rheb
- Rap
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| 3.6.5.3: 蛋白质合成GTP酶 | |
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| 3.6.5.5-6: 聚合马达 | |
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| EC 1.1/2/3/4/5/6/7/8/9/10/11/12/13/14/15/16/17/18/19/20/21/22 · 2.1/2/3/4/5/6/7(2.7.10/11-12)/8/9 · 3.1/2/3/4(3.4.21/22/23/24)/5/6/7/8/9/10/11/12/13 · 4.1/2/3/4/5/6 · 5.1/2/3/4/5/99 · 6.1-3(英语:Template:Ligases CO CS and CN)/4/5-6 |
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