CDCP1 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | CDCP1, CD318, SIMA135, TRASK, CUB domain containing protein 1 |
---|
Внешние ID | OMIM: 611735 MGI: 2442010 HomoloGene: 11276 GeneCards: CDCP1 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![9-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/41/Ideogram_house_mouse_chromosome_9.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_9.svg.png) | Хр. | 9-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 9|9 F4 | Начало | 122,999,889 bp[2] |
---|
Конец | 123,045,103 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - gingival epithelium
- mucosa of esophagus
- mucosa of transverse colon
- pancreatic ductal cell
|
| Наибольшая экспрессия в | - conjunctival fornix
- lactiferous gland
- Ileal epithelium
- mucous cell of stomach
- epithelium of stomach
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a8/PBB_GE_CDCP1_218451_at_fs.png/250px-PBB_GE_CDCP1_218451_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 3: 45.08 – 45.15 Mb | Chr 9: 123 – 123.05 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
CDCP1 (англ. CUB domain-containing protein 1, белок, содержащий CUB-домен; CD318) — мембранный белок, регулятор клеточной адгезии. Продукт гена человека CDCP1[5][6].
Функции
CDCP1/Trask является трансмембранным гликопротеином, молекулярная масса 140 кДа. Белок содержит большой внеклеточный домен с двумя CUB-доменами и внутриклеточный доман с 5 тирозинами. Фосфорилирование тирозинов белка тесно связано с регуляцией состояния клеточной адгезии[7]. В культуре клеток фосфорилирование CDCP1 связано с процессом отделения клеток от подложки при обработке трипсином или ЭДТА, а также в процессе митотического отделения. Особенно высокий уровень экспрессии CDCP1 обнаружен в эпителиальных клетках, в которых фосфорилирование белка происходит при митотическом отделении клеток либо в откреплённом фенотипе. Таким образом, фосфорилирование CDCP1 обратно коррелирует с состоянием прикреплённости клетки.
Фосфорилируется тирозинкиназами семейства SRC, включая SRC и YES, а также протеинкиназой C-гамма/PRKCG.
Клиническое значение
Фосфорилирование CDCP1 обнаружено во многих раковых клетках, включая некоторые преметастатические раковые опухоли, а также в метастазирующих клетках и в метастазах[8].
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163814 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000035498 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Scherl-Mostageer M., Sommergruber W., Abseher R., Hauptmann R., Ambros P., Schweifer N. Identification of a novel gene, CDCP1, overexpressed in human colorectal cancer (англ.) // Oncogene[англ.] : journal. — 2001. — July (vol. 20, no. 32). — P. 4402—4408. — doi:10.1038/sj.onc.1204566. — PMID 11466621.
- ↑ Entrez Gene: CDCP1 CUB domain containing protein 1 (неопр.).
- ↑ Spassov D.S., Ahuja D., Wong C.H., Moasser M.M. The structural features of Trask that mediate its anti-adhesive functions (англ.) // PLoS One : journal. — 2011. — Vol. 6, no. 4. — P. e19154. — doi:10.1371/journal.pone.0019154. — PMID 21559459. — PMC 3084758.
- ↑ Wortmann A., He Y., Deryugina E.I., Quigley J.P., Hooper J.D. The cell surface glycoprotein CDCP1 in cancer--insights, opportunities, and challenges (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2009. — July (vol. 61, no. 7). — P. 723—730. — doi:10.1002/iub.198. — PMID 19514048.
Литература
- Xia Y., Gil S.G., Carter W.G. Anchorage mediated by integrin alpha6beta4 to laminin 5 (epiligrin) regulates tyrosine phosphorylation of a membrane-associated 80-kD protein (англ.) // The Journal of Cell Biology[англ.] : journal. — 1996. — February (vol. 132, no. 4). — P. 727—740. — doi:10.1083/jcb.132.4.727. — PMID 8647901. — PMC 2199869.
- Hooper J.D., Zijlstra A., Aimes R.T., Liang H., Claassen G.F., Tarin D., Testa J.E., Quigley J.P. Subtractive immunization using highly metastatic human tumor cells identifies SIMA135/CDCP1, a 135 kDa cell surface phosphorylated glycoprotein antigen (англ.) // Oncogene[англ.] : journal. — 2003. — March (vol. 22, no. 12). — P. 1783—1794. — doi:10.1038/sj.onc.1206220. — PMID 12660814.
- Conze T., Lammers R., Kuci S., Scherl-Mostageer M., Schweifer N., Kanz L., Buhring H.J. CDCP1 is a novel marker for hematopoietic stem cells (англ.) // Annals of the New York Academy of Sciences[англ.] : journal. — 2003. — May (vol. 996, no. 1). — P. 222—226. — doi:10.1111/j.1749-6632.2003.tb03249.x. — PMID 12799299.
- Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E., Baker K., Baldwin D., Brush J., Chen J., Chow B., Chui C., Crowley C., Currell B., Deuel B., Dowd P., Eaton D., Foster J., Grimaldi C., Gu Q., Hass P.E., Heldens S., Huang A., Kim H.S., Klimowski L., Jin Y., Johnson S., Lee J., Lewis L., Liao D., Mark M., Robbie E., Sanchez C., Schoenfeld J., Seshagiri S., Simmons L., Singh J., Smith V., Stinson J., Vagts A., Vandlen R., Watanabe C., Wieand D., Woods K., Xie M.H., Yansura D., Yi S., Yu G., Yuan J., Zhang M., Zhang Z., Goddard A., Wood W.I., Godowski P., Gray A. The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment (англ.) // Genome Research[англ.] : journal. — 2003. — October (vol. 13, no. 10). — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
- Brown T.A., Yang T.M., Zaitsevskaia T., Xia Y., Dunn C.A., Sigle R.O., Knudsen B., Carter W.G. Adhesion or plasmin regulates tyrosine phosphorylation of a novel membrane glycoprotein p80/gp140/CUB domain-containing protein 1 in epithelia (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2004. — April (vol. 279, no. 15). — P. 14772—14783. — doi:10.1074/jbc.M309678200. — PMID 14739293.
- Bühring H.J., Kuçi S., Conze T., Rathke G., Bartolović K., Grünebach F., Scherl-Mostageer M., Brümmendorf T.H., Schweifer N., Lammers R. CDCP1 identifies a broad spectrum of normal and malignant stem/progenitor cell subsets of hematopoietic and nonhematopoietic origin (англ.) // Stem Cells : journal. — 2005. — Vol. 22, no. 3. — P. 334—343. — doi:10.1634/stemcells.22-3-334. — PMID 15153610.
- Benes C.H., Wu N., Elia A.E., Dharia T., Cantley L.C., Soltoff S.P. The C2 domain of PKCdelta is a phosphotyrosine binding domain (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2005. — April (vol. 121, no. 2). — P. 271—280. — doi:10.1016/j.cell.2005.02.019. — PMID 15851033.
- Bhatt A.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Craik C.S., Moasser M.M. Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases (англ.) // Oncogene[англ.] : journal. — 2005. — August (vol. 24, no. 34). — P. 5333—5343. — doi:10.1038/sj.onc.1208582. — PMID 16007225. — PMC 3023961.
- André M., Le Caer J.P., Greco C., Planchon S., El Nemer W., Boucheix C., Rubinstein E., Chamot-Rooke J., Le Naour F. Proteomic analysis of the tetraspanin web using LC-ESI-MS/MS and MALDI-FTICR-MS (англ.) // Proteomics : journal. — 2006. — March (vol. 6, no. 5). — P. 1437—1449. — doi:10.1002/pmic.200500180. — PMID 16404722.
- Kimura H., Morii E., Ikeda J.I., Ezoe S., Xu J.X., Nakamichi N., Tomita Y., Shibayama H., Kanakura Y., Aozasa K. Role of DNA methylation for expression of novel stem cell marker CDCP1 in hematopoietic cells (англ.) // Leukemia : journal. — 2006. — September (vol. 20, no. 9). — P. 1551—1556. — doi:10.1038/sj.leu.2404312. — PMID 16926850.
- Perry S.E., Robinson P., Melcher A., Quirke P., Bühring H.J., Cook G.P., Blair G.E. Expression of the CUB domain containing protein 1 (CDCP1) gene in colorectal tumour cells (англ.) // FEBS Letters[англ.] : journal. — 2007. — March (vol. 581, no. 6). — P. 1137—1142. — doi:10.1016/j.febslet.2007.02.025. — PMID 17335815.
- Uekita T., Jia L., Narisawa-Saito M., Yokota J., Kiyono T., Sakai R. CUB domain-containing protein 1 is a novel regulator of anoikis resistance in lung adenocarcinoma (англ.) // Molecular and Cellular Biology?! : journal. — 2007. — November (vol. 27, no. 21). — P. 7649—7660. — doi:10.1128/MCB.01246-07. — PMID 17785447. — PMC 2169043.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|