CLEC10A |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | CLEC10A, CD301, CLECSF13, CLECSF14, HML, HML2, MGL, C-type lectin domain family 10 member A, C-type lectin domain containing 10A |
---|
Внешние ID | OMIM: 605999 MGI: 96975 HomoloGene: 7836 GeneCards: CLEC10A |
---|
|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
| Наибольшая экспрессия в | - stroma of bone marrow
- skin of external ear
- subcutaneous adipose tissue
- tunica adventitia of aorta
- primary oocyte
- muscle of thigh
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | |
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | | Компонент клетки | - часть мембраны
- клеточная мембрана
- мембрана
| Биологический процесс | - врождённый иммунитет
- эндоцитоз
- adaptive immune response
- immune system process
- stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | |
---|
NM_006344 NM_182906 NM_001330070 |
| |
---|
RefSeq (белок) | |
---|
NP_001316999 NP_006335 NP_878910 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Chr 17: 7.07 – 7.08 Mb | Chr 11: 70.05 – 70.06 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
CLEC10A (англ. C-type lectin domain family 10 member A, лектин С-типа домен семейство 10 член A) — мембранный белок, лектин типа С. Продукт гена человека CLEC10A[5].
Функции
Белок относится к суперсемейству белков CTL/CTLD (лектин типа С/лектин типа С-подобный домен). Члены этого семейства имеют сходную белковую структуру и обладают разнообразными функциями, такими как адгезия клеток, межклеточная передача сигнала, метаболизм гликопротеинов, роль в воспалении и иммунном ответе. CLEC10A является трансмембранным белком 2-го типа и может функционировать как клеточный поверхностный антиген. Существует две изоформы белка[6].
Участвует в регуляции врождённого и приобретённого иммунитета. Связывает концевые галактозу и N-ацетилгалактозамин, связанные с серином или треонином. Подобные углеводные соединения известны как Tn-Ag и экспрессированы на клетках различных карцином.
Структура
Белок состоит из 316 аминокислот, содержит один трансмембранный домен. Внеклеточный домен содержит два участка N-гликозилирования аспарагиновых остатков и 3 дисульфидные связи.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000132514 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000318 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Suzuki N., Yamamoto K., Toyoshima S., Osawa T., Irimura T. Molecular cloning and expression of cDNA encoding human macrophage C-type lectin. Its unique carbohydrate binding specificity for Tn antigen (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 1996. — January (vol. 156, no. 1). — P. 128—135. — PMID 8598452. Архивировано 23 июля 2008 года.
- ↑ Entrez Gene: CLEC10A C-type lectin domain family 10, member A (неопр.).
Литература
- Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery. (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
- Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- van Vliet S.J., Steeghs L., Bruijns S.C. et al. Variation of Neisseria gonorrhoeae Lipooligosaccharide Directs Dendritic Cell–Induced T Helper Responses (англ.) // PLoS Pathog. : journal / Seifert, H. Steven. — 2009. — Vol. 5, no. 10. — P. e1000625. — doi:10.1371/journal.ppat.1000625. — PMID 19834553. — PMC 2757725.
- Iijima M., Tomita M., Morozumi S. et al. Single nucleotide polymorphism of TAG-1 influences IVIg responsiveness of Japanese patients with CIDP (англ.) // Neurology[англ.] : journal. — Wolters Kluwer[англ.], 2009. — Vol. 73, no. 17. — P. 1348—1352. — doi:10.1212/WNL.0b013e3181bd1139. — PMID 19776380.
- Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|