Кератин-16

Ідентифікатори

Символи

KRT16, CK16, FNEPPK, K16, K1CP, KRT16A, NEPPK, PC1, keratin 16

Зовнішні ІД

OMIM: 148067 MGI: 96690 HomoloGene: 21145 GeneCards: KRT16

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural molecule activity
Клітинна компонента	• екзосома • цитоскелет • Проміжні філаменти • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• morphogenesis of an epithelium • hair cycle • keratinocyte migration • GO:0010260 старіння людини • проліферація • inflammatory response • negative regulation of cell migration • вроджений імунітет • cytoskeleton organization • keratinocyte differentiation • epidermis development • intermediate filament cytoskeleton organization • establishment of skin barrier • keratinization • cornification
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3868


16666

Ensembl


ENSG00000186832


ENSMUSG00000053797

UniProt


P08779


Q9Z2K1

RefSeq (мРНК)


NM_005557


NM_008470 NM_001313958

RefSeq (білок)


NP_005548


NP_001300887 NP_032496

Локус (UCSC)

Хр. 17: 41.61 – 41.62 Mb

Хр. 11: 100.14 – 100.14 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Кератин-16 (англ. Keratin 16) – білок, який кодується геном KRT16, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 51 268^[4].

Належить до великої родини кератинів — структурних білків цитоскелету.

Мутації в цьому гені призводять до рідкісного захворювання пахіоніхія спадкова^[en].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTTCSRQFTS	SSSMKGSCGI	GGGIGGGSSR	ISSVLAGGSC	RAPSTYGGGL
SVSSRFSSGG	ACGLGGGYGG	GFSSSSSFGS	GFGGGYGGGL	GAGFGGGLGA
GFGGGFAGGD	GLLVGSEKVT	MQNLNDRLAS	YLDKVRALEE	ANADLEVKIR
DWYQRQRPSE	IKDYSPYFKT	IEDLRNKIIA	ATIENAQPIL	QIDNARLAAD
DFRTKYEHEL	ALRQTVEADV	NGLRRVLDEL	TLARTDLEMQ	IEGLKEELAY
LRKNHEEEML	ALRGQTGGDV	NVEMDAAPGV	DLSRILNEMR	DQYEQMAEKN
RRDAETWFLS	KTEELNKEVA	SNSELVQSSR	SEVTELRRVL	QGLEIELQSQ
LSMKASLENS	LEETKGRYCM	QLSQIQGLIG	SVEEQLAQLR	CEMEQQSQEY
QILLDVKTRL	EQEIATYRRL	LEGEDAHLSS	QQASGQSYSS	REVFTSSSSS
SSRQTRPILK	EQSSSSFSQG	QSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Література

Raychaudhury A., Marchuk D., Lindhurst M., Fuchs E. (1986). Three tightly linked genes encoding human type I keratins: conservation of sequence in the 5'-untranslated leader and 5'-upstream regions of coexpressed keratin genes. Mol. Cell. Biol. 6: 539—548. PMID 2431270 DOI:10.1128/MCB.6.2.539
Rosenberg M., Raychaudhury A., Shows T.B., le Beau M.M., Fuchs E. (1988). A group of type I keratin genes on human chromosome 17: characterization and expression. Mol. Cell. Biol. 8: 722—736. PMID 2451124 DOI:10.1128/MCB.8.2.722
Paladini R.D., Takahashi K., Gant T.M., Coulombe P.A. (1995). cDNA cloning and bacterial expression of the human type I keratin 16. Biochem. Biophys. Res. Commun. 215: 517—523. PMID 7487986 DOI:10.1006/bbrc.1995.2495
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Connors J.B., Rahil A.K., Smith F.J.D., McLean W.H.I., Milstone L.M. (2001). Delayed-onset pachyonychia congenita associated with a novel mutation in the central 2B domain of keratin 16. Br. J. Dermatol. 144: 1058—1062. PMID 11359398 DOI:10.1046/j.1365-2133.2001.04199.x
Paris F., Hurtado C., Azon A., Aguado L., Vizmanos J.L. (2013). A new KRT16 mutation associated with a phenotype of pachyonychia congenita. Exp. Dermatol. 22: 838—839. PMID 24118415 DOI:10.1111/exd.12262

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6423 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 30 січня 2017.
↑ UniProt, P08779 (англ.) . Архів оригіналу за 20 грудня 2016. Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Білки цитоскелету

Людські

Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки

Міофіламенти

Актин	A1 A2 B C1 G1 G2

Міозин	I A B C D E F G H II 1 2 3 4 6 7 7B 8 9 10 11 13 14 15 16 III A B V A B C VI MYO6 VII A B IX A B X MYO10 XV A B XVIII A B Легкий ланцюг міозину 1 2 3 4 5 6 6B 7 9 10 12A 12B IP K K2 K3 K4 L1 PF

Інші	Тропомодулін 1 2 3 4 Тропонін T 1 2 3 C 1 2 I 1 2 3 Тропоміозин 1 2 3 4 Актинін 1 2 3 4 Комплекс Arp2/3 актин-деполімеризуючі фактори Кофілін 1 2 дестрин Гелсолін Профілін 1 2 Тітин

Інші

WAS
Фібрилін
Філамін
- A
- B
- C
Еспін
TRIOBP

Проміжні філаменти

Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)

Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 10 12 13 14 15 16 17 19 20 хромосома 12 18 інші 21 тип II/хромосома 12 1 2 3 4 5 6A 6B 7 8 9

Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 31 32 33A 33B 34 35 36 37 38 тип II/хромосома 12 81 82 83 84 85 86

Незгруповані альфа	хромосома 17 23 24 25 26 27 28 39 40 хромосома 12 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80

Не-альфа	Бета-кератин

Тип 3

Тип 4

Інтернексин
Нестин
Нейрофіламент
- NEFL
- NEFM
- NEFH
Синемін
Синкоїлін

Тип 5

Ламіни: A/C
B1
B2

Мікротрубочки
та пов'язані білки

Тубулін	1A 1B 1C 3C 3D 3E 4A 8

Кінезин	1A 1B 2A 2C 3B 3C 4A 4B 5A 5B 5C 6 7 9 11 12 13A 13B 14 15 16B 17 18A 18B 19 20A 20B 21A 21B 22 23 24 25 26A 26B 27 C1 C2 C3

Динеїн	аксонемні: 1 2 3 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 17 I1 I2 LI1 L1 L4 цитоплазматичні: C1H1 C2H1 C1I1 C1I2 C1LI1 C1LI2 C2LI1 LL1 LL2 LRB1 LRB2 LT1 LT3

Інші	MAPT DCTN1 STMN1 Тектин 1 2 3 4 5 Динамін 1 2 3