UTRN

UTRN
Наявні структури
PDBПошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1BHD, 1QAG,%%s1BHD, 1QAG

Ідентифікатори
Символи UTRN, DMDL, DRP, DRP1, utrophin
Зовнішні ІД OMIM: 128240 MGI: 104631 HomoloGene: 21398 GeneCards: UTRN
Онтологія гена
Молекулярна функція

vinculin binding
zinc ion binding
зв'язування з іоном металу
integrin binding
actin filament binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
actin binding
protein kinase binding

Клітинна компонента

цитоплазма
postsynaptic membrane
contractile ring
мембрана
Філоподія
growth cone
neuromuscular junction
клітинна мембрана
синапс
dystrophin-associated glycoprotein complex
нуклеоплазма
міжклітинні контакти
cortical actin cytoskeleton
Сарколема
екзосома
цитоскелет
filopodium membrane
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

м'язове скорочення
positive regulation of cell-matrix adhesion
muscle organ development
neuromuscular junction development
regulation of sodium ion transmembrane transporter activity
response to denervation involved in regulation of muscle adaptation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7402
22288
Ensembl
ENSG00000152818
ENSMUSG00000019820
UniProt
P46939
Q5T097
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_007124
NM_001375323
NM_011682
RefSeq (білок)
NP_009055
NP_001362252
н/д
Локус (UCSC) Хр. 6: 144.29 – 144.85 Mb Хр. 10: 12.26 – 12.75 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

UTRN (англ. Utrophin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 433 амінокислот, а молекулярна маса — 394 466[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAKYGEHEASPDNGQNEFSDIIKSRSDEHNDVQKKTFTKWINARFSKSGK
PPINDMFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVL
HQNNVELVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDVMSDLQQT
NSEKILLSWVRQTTRPYSQVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWD
KVVKMSPIERLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSL
FEVLPQQVTIDAIREVETLPRKYKKECEEEAINIQSTAPEEEHESPRAET
PSTVTEVDMDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDDVEEVKDQFA
THEAFMMELTAHQSSVGSVLQAGNQLITQGTLSDEEEFEIQEQMTLLNAR
WEALRVESMDRQSRLHDVLMELQKKQLQQLSAWLTLTEERIQKMETCPLD
DDVKSLQKLLEEHKSLQSDLEAEQVKVNSLTHMVVIVDENSGESATAILE
DQLQKLGERWTAVCRWTEERWNRLQEINILWQELLEEQCLLKAWLTEKEE
ALNKVQTSNFKDQKELSVSVRRLAILKEDMEMKRQTLDQLSEIGQDVGQL
LDNSKASKKINSDSEELTQRWDSLVQRLEDSSNQVTQAVAKLGMSQIPQK
DLLETVRVREQAITKKSKQELPPPPPPKKRQIHVDIEAKKKFDAISAELL
NWILKWKTAIQTTEIKEYMKMQDTSEMKKKLKALEKEQRERIPRADELNQ
TGQILVEQMGKEGLPTEEIKNVLEKVSSEWKNVSQHLEDLERKIQLQEDI
NAYFKQLDELEKVIKTKEEWVKHTSISESSRQSLPSLKDSCQRELTNLLG
LHPKIEMARASCSALMSQPSAPDFVQRGFDSFLGRYQAVQEAVEDRQQHL
ENELKGQPGHAYLETLKTLKDVLNDSENKAQVSLNVLNDLAKVEKALQEK
KTLDEILENQKPALHKLAEETKALEKNVHPDVEKLYKQEFDDVQGKWNKL
KVLVSKDLHLLEEIALTLRAFEADSTVIEKWMDGVKDFLMKQQAAQGDDA
GLQRQLDQCSAFVNEIETIESSLKNMKEIETNLRSGPVAGIKTWVQTRLG
DYQTQLEKLSKEIATQKSRLSESQEKAANLKKDLAEMQEWMTQAEEEYLE
RDFEYKSPEELESAVEEMKRAKEDVLQKEVRVKILKDNIKLLAAKVPSGG
QELTSELNVVLENYQLLCNRIRGKCHTLEEVWSCWIELLHYLDLETTWLN
TLEERMKSTEVLPEKTDAVNEALESLESVLRHPADNRTQIRELGQTLIDG
GILDDIISEKLEAFNSRYEDLSHLAESKQISLEKQLQVLRETDQMLQVLQ
ESLGELDKQLTTYLTDRIDAFQVPQEAQKIQAEISAHELTLEELRRNMRS
QPLTSPESRTARGGSQMDVLQRKLREVSTKFQLFQKPANFEQRMLDCKRV
LDGVKAELHVLDVKDVDPDVIQTHLDKCMKLYKTLSEVKLEVETVIKTGR
HIVQKQQTDNPKGMDEQLTSLKVLYNDLGAQVTEGKQDLERASQLARKMK
KEAASLSEWLSATETELVQKSTSEGLLGDLDTEISWAKNVLKDLEKRKAD
LNTITESSAALQNLIEGSEPILEERLCVLNAGWSRVRTWTEDWCNTLMNH
QNQLEIFDGNVAHISTWLYQAEALLDEIEKKPTSKQEEIVKRLVSELDDA
NLQVENVRDQALILMNARGSSSRELVEPKLAELNRNFEKVSQHIKSAKLL
IAQEPLYQCLVTTETFETGVPFSDLEKLENDIENMLKFVEKHLESSDEDE
KMDEESAQIEEVLQRGEEMLHQPMEDNKKEKIRLQLLLLHTRYNKIKAIP
IQQRKMGQLASGIRSSLLPTDYLVEINKILLCMDDVELSLNVPELNTAIY
EDFSFQEDSLKNIKDQLDKLGEQIAVIHEKQPDVILEASGPEAIQIRDTL
TQLNAKWDRINRMYSDRKGCFDRAMEEWRQFHCDLNDLTQWITEAEELLV
DTCAPGGSLDLEKARIHQQELEVGISSHQPSFAALNRTGDGIVQKLSQAD
GSFLKEKLAGLNQRWDAIVAEVKDRQPRLKGESKQVMKYRHQLDEIICWL
TKAEHAMQKRSTTELGENLQELRDLTQEMEVHAEKLKWLNRTELEMLSDK
SLSLPERDKISESLRTVNMTWNKICREVPTTLKECIQEPSSVSQTRIAAH
PNVQKVVLVSSASDIPVQSHRTSEISIPADLDKTITELADWLVLIDQMLK
SNIVTVGDVEEINKTVSRMKITKADLEQRHPQLDYVFTLAQNLKNKASSS
DMRTAITEKLERVKNQWDGTQHGVELRQQQLEDMIIDSLQWDDHREETEE
LMRKYEARLYILQQARRDPLTKQISDNQILLQELGPGDGIVMAFDNVLQK
LLEEYGSDDTRNVKETTEYLKTSWINLKQSIADRQNALEAEWRTVQASRR
DLENFLKWIQEAETTVNVLVDASHRENALQDSILARELKQQMQDIQAEID
AHNDIFKSIDGNRQKMVKALGNSEEATMLQHRLDDMNQRWNDLKAKSASI
RAHLEASAEKWNRLLMSLEELIKWLNMKDEELKKQMPIGGDVPALQLQYD
HCKALRRELKEKEYSVLNAVDQARVFLADQPIEAPEEPRRNLQSKTELTP
EERAQKIAKAMRKQSSEVKEKWESLNAVTSNWQKQVDKALEKLRDLQGAM
DDLDADMKEAESVRNGWKPVGDLLIDSLQDHIEKIMAFREEIAPINFKVK
TVNDLSSQLSPLDLHPSLKMSRQLDDLNMRWKLLQVSVDDRLKQLQEAHR
DFGPSSQHFLSTSVQLPWQRSISHNKVPYYINHQTQTTCWDHPKMTELFQ
SLADLNNVRFSAYRTAIKIRRLQKALCLDLLELSTTNEIFKQHKLNQNDQ
LLSVPDVINCLTTTYDGLEQMHKDLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGK
IRVQSLKIGLMSLSKGLLEEKYRYLFKEVAGPTEMCDQRQLGLLLHDAIQ
IPRQLGEVAAFGGSNIEPSVRSCFQQNNNKPEISVKEFIDWMHLEPQSMV
WLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIVGFRYRSLKHFNYDVCQSCFFS
GRTAKGHKLHYPMVEYCIPTTSGEDVRDFTKVLKNKFRSKKYFAKHPRLG
YLPVQTVLEGDNLETPITLISMWPEHYDPSQSPQLFHDDTHSRIEQYATR
LAQMERTNGSFLTDSSSTTGSVEDEHALIQQYCQTLGGESPVSQPQSPAQ
ILKSVEREERGELERIIADLEEEQRNLQVEYEQLKDQHLRRGLPVGSPPE
SIISPHHTSEDSELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLHRLR
QLLEQPESDSRINGVSPWASPQHSALSYSLDPDASGPQFHQAAGEDLLAP
PHDTSTDLTEVMEQIHSTFPSCCPNVPSRPQAM

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

  • Wilson J., Putt W., Jimenez C., Edwards Y.H. (1999). Up71 and up140, two novel transcripts of utrophin that are homologues of short forms of dystrophin. Hum. Mol. Genet. 8: 1271—1278. PMID 10369873 DOI:10.1093/hmg/8.7.1271
  • Burton E.A., Tinsley J.M., Holzfeind P.J., Rodrigues N.R., Davies K.E. (1999). A second promoter provides an alternative target for therapeutic up-regulation of utrophin in Duchenne muscular dystrophy. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 14025—14030. PMID 10570192 DOI:10.1073/pnas.96.24.14025
  • Ahn A.H., Kunkel L.M. (1995). Syntrophin binds to an alternatively spliced exon of dystrophin. J. Cell Biol. 128: 363—371. PMID 7844150 DOI:10.1083/jcb.128.3.363
  • Tommasi di Vignano A., Di Zenzo G., Sudol M., Cesareni G., Dente L. (2000). Contribution of the different modules in the utrophin carboxy-terminal region to the formation and regulation of the DAP complex. FEBS Lett. 471: 229—234. PMID 10767429 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01400-9
  • Bhosle R.C., Michele D.E., Campbell K.P., Li Z., Robson R.M. (2006). Interactions of intermediate filament protein synemin with dystrophin and utrophin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 346: 768—777. PMID 16777071 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.05.192
  • Singh S.M., Bandi S., Winder S.J., Mallela K.M. (2014). The actin binding affinity of the utrophin tandem calponin-homology domain is primarily determined by its N-terminal domain. Biochemistry. 53: 1801—1809. PMID 24628267 DOI:10.1021/bi500149q

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12635 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
  4. UniProt, P46939 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Людські
Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки
Міофіламенти
Актин
Міозин
Інші
Інші
Проміжні філаменти
Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)
Епітеліальні кератини
(м'які альфа-кератини)
Кератини волосся
(жорсткі альфа-кератини)
Незгруповані альфа
Не-альфа
  • Бета-кератин
Тип 3
Тип 4
Тип 5
Мікротрубочки
та пов'язані білки
Тубулін
Кінезин
Динеїн
Інші
Катеніни
Мембранні
Інші
Нелюдські