DYNC2H1

DYNC2H1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4RH7

Ідентифікатори
Символи DYNC2H1, ATD3, DHC1b, DHC2, DNCH2, DYH1B, SRPS2B, SRTD3, hdhc11, dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1
Зовнішні ІД OMIM: 603297 MGI: 107736 HomoloGene: 14468 GeneCards: DYNC2H1
Пов'язані генетичні захворювання
туберкульоз, Verma-Naumoff syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

microtubule motor activity
nucleotide binding
ATPase activity
cytoskeletal motor activity
ATP binding
minus-end-directed microtubule motor activity
dynein light chain binding
dynein intermediate chain binding
dynein light intermediate chain binding

Клітинна компонента

цитоплазма
комплекс Ґольджі
cell projection
мембрана
клітинна мембрана
ciliary tip
dynein complex
мікротрубочка
екзосома
цитоскелет
війка
cytoplasmic dynein complex
apical part of cell
GO:0035085 Аксонема
motile cilium

Біологічний процес

Golgi organization
multicellular organism development
microtubule-based movement
cell projection organization
intraciliary transport involved in cilium assembly
determination of left/right symmetry
heart development
dorsal/ventral pattern formation
protein processing
spinal cord motor neuron differentiation
neuron differentiation
embryonic limb morphogenesis
forebrain development
positive regulation of smoothened signaling pathway
coronary vasculature development
non-motile cilium assembly
intraciliary retrograde transport
cilium assembly
protein localization to cilium

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
79659
110350
Ensembl
ENSG00000187240
ENSMUSG00000047193
UniProt
Q8NCM8
Q45VK7
RefSeq (мРНК)
NM_001080463
NM_001377
NM_024606
NM_029851
NM_001364519
NM_138307
RefSeq (білок)
NP_001073932
NP_001368
NP_084127
NP_001351448
Локус (UCSC) Хр. 11: 103.11 – 103.48 Mb Хр. 9: 6.93 – 7.18 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DYNC2H1 (англ. Dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 307 амінокислот, а молекулярна маса — 492 622[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MANGTADVRKLFIFTTTQNYFGLMSELWDQPLLCNCLEINNFLDDGNQML
LRVQRSDAGISFSNTIEFGDTKDKVLVFFKLRPEVITDENLHDNILVSSM
LESPISSLYQAVRQVFAPMLLKDQEWSRNFDPKLQNLLSELEAGLGIVLR
RSDTNLTKLKFKEDDTRGILTPSDEFQFWIEQAHRGNKQISKERANYFKE
LFETIAREFYNLDSLSLLEVVDLVETTQDVVDDVWRQTEHDHYPESRMLH
LLDIIGGSFGRFVQKKLGTLNLWEDPYYLVKESLKAGISICEQWVIVCNH
LTGQVWQRYVPHPWKNEKYFPETLDKLGKRLEEVLAIRTIHEKFLYFLPA
SEEKIICLTRVFEPFTGLNPVQYNPYTEPLWKAAVSQYEKIIAPAEQKIA
GKLKNYISEIQDSPQQLLQAFLKYKELVKRPTISKELMLERETLLARLVD
SIKDFRLDFENRCRGIPGDASGPLSGKNLSEVVNSIVWVRQLELKVDDTI
KIAEALLSDLPGFRCFHQSAKDLLDQLKLYEQEQFDDWSRDIQSGLSDSR
SGLCIEASSRIMELDSNDGLLKVHYSDRLVILLREVRQLSALGFVIPAKI
QQVANIAQKFCKQAIILKQVAHFYNSIDQQMIQSQRPMMLQSALAFEQII
KNSKAGSGGKSQITWDNPKELEGYIQKLQNAAERLATENRKLRKWHTTFC
EKVVVLMNIDLLRQQQRWKDGLQELRTGLATVEAQGFQASDMHAWKQHWN
HQLYKALEHQYQMGLEALNENLPEINIDLTYKQGRLQFRPPFEEIRAKYY
REMKRFIGIPNQFKGVGEAGDESIFSIMIDRNASGFLTIFSKAEDLFRRL
SAVLHQHKEWIVIGQVDMEALVEKHLFTVHDWEKNFKALKIKGKEVERLP
SAVKVDCLNINCNPVKTVIDDLIQKLFDLLVLSLKKSIQAHLHEIDTFVT
EAMEVLTIMPQSVEEIGDANLQYSKLQERKPEILPLFQEAEDKNRLLRTV
AGGGLETISNLKAKWDKFELMMESHQLMIKDQIEVMKGNVKSRLQIYYQE
LEKFKARWDQLKPGDDVIETGQHNTLDKSAKLIKEKKIEFDDLEVTRKKL
VDDCHHFRLEEPNFSLASSISKDIESCAQIWAFYEEFQQGFQEMANEDWI
TFRTKTYLFEEFLMNWHDRLRKVEEHSVMTVKLQSEVDKYKIVIPILKYV
RGEHLSPDHWLDLFRLLGLPRGTSLEKLLFGDLLRVADTIVAKAADLKDL
NSRAQGEVTIREALRELDLWGVGAVFTLIDYEDSQSRTMKLIKDWKDIVN
QVGDNRCLLQSLKDSPYYKGFEDKVSIWERKLAELDEYLQNLNHIQRKWV
YLEPIFGRGALPKEQTRFNRVDEDFRSIMTDIKKDNRVTTLTTHAGIRNS
LLTILDQLQRCQKSLNEFLEEKRSAFPRFYFIGDDDLLEILGQSTNPSVI
QSHLKKLFAGINSVCFDEKSKHITAMKSLEGEVVPFKNKVPLSNNVETWL
NDLALEMKKTLEQLLKECVTTGRSSQGAVDPSLFPSQILCLAEQIKFTED
VENAIKDHSLHQIETQLVNKLEQYTNIDTSSEDPGNTESGILELKLKALI
LDIIHNIDVVKQLNQIQVHTTEDWAWKKQLRFYMKSDHTCCVQMVDSEFQ
YTYEYQGNASKLVYTPLTDKCYLTLTQAMKMGLGGNPYGPAGTGKTESVK
ALGGLLGRQVLVFNCDEGIDVKSMGRIFVGLVKCGAWGCFDEFNRLEESV
LSAVSMQIQTIQDALKNHRTVCELLGKEVEVNSNSGIFITMNPAGKGYGG
RQKLPDNLKQLFRPVAMSHPDNELIAEVILYSEGFKDAKVLSRKLVAIFN
LSRELLTPQQHYDWGLRALKTVLRGSGNLLRQLNKSGTTQNANESHIVVQ
ALRLNTMSKFTFTDCTRFDALIKDVFPGIELKEVEYDELSAALKQVFEEA
NYEIIPNQIKKALELYEQLCQRMGVVIVGPSGAGKSTLWRMLRAALCKTG
KVVKQYTMNPKAMPRYQLLGHIDMDTREWSDGVLTNSARQVVREPQDVSS
WIICDGDIDPEWIESLNSVLDDNRLLTMPSGERIQFGPNVNFVFETHDLS
CASPATISRMGMIFLSDEETDLNSLIKSWLRNQPAEYRNNLENWIGDYFE
KALQWVLKQNDYVVETSLVGTVMNGLSHLHGCRDHDEFIINLIRGLGGNL
NMKSRLEFTKEVFHWARESPPDFHKPMDTYYDSTRGRLATYVLKKPEDLT
ADDFSNGLTLPVIQTPDMQRGLDYFKPWLSSDTKQPFILVGPEGCGKGML
LRYAFSQLRSTQIATVHCSAQTTSRHLLQKLSQTCMVISTNTGRVYRPKD
CERLVLYLKDINLPKLDKWGTSTLVAFLQQVLTYQGFYDENLEWVGLENI
QIVASMSAGGRLGRHKLTTRFTSIVRLCSIDYPEREQLQTIYGAYLEPVL
HKNLKNHSIWGSSSKIYLLAGSMVQVYEQVRAKFTVDDYSHYFFTPCILT
QWVLGLFRYDLEGGSSNHPLDYVLEIVAYEARRLFRDKIVGAKELHLFDI
ILTSVFQGDWGSDILDNMSDSFYVTWGARHNSGARAAPGQPLPPHGKPLG
KLNSTDLKDVIKKGLIHYGRDNQNLDILLFHEVLEYMSRIDRVLSFPGGS
LLLAGRSGVGRRTITSLVSHMHGAVLFSPKISRGYELKQFKNDLKHVLQL
AGIEAQQVVLLLEDYQFVHPTFLEMINSLLSSGEVPGLYTLEELEPLLLP
LKDQASQDGFFGPVFNYFTYRIQQNLHIVLIMDSANSNFMINCESNPALH
KKCQVLWMEGWSNSSMKKIPEMLFSETGGGEKYNDKKRKEEKKKNSVDPD
FLKSFLLIHESCKAYGATPSRYMTFLHVYSAISSSKKKELLKRQSHLQAG
VSKLNEAKALVDELNRKAGEQSVLLKTKQDEADAALQMITVSMQDASEQK
TELERLKHRIAEEVVKIEERKNKIDDELKEVQPLVNEAKLAVGNIKPESL
SEIRSLRMPPDVIRDILEGVLRLMGIFDTSWVSMKSFLAKRGVREDIATF
DARNISKEIRESVEELLFKNKGSFDPKNAKRASTAAAPLAAWVKANIQYS
HVLERIHPLETEQAGLESNLKKTEDRKRKLEELLNSVGQKVSELKEKFQS
RTSEAAKLEAEVSKAQETIKAAEVLINQLDREHKRWNAQVVEITEELATL
PKRAQLAAAFITYLSAAPESLRKTCLEEWTKSAGLEKFDLRRFLCTESEQ
LIWKSEGLPSDDLSIENALVILQSRVCPFLIDPSSQATEWLKTHLKDSRL
EVINQQDSNFITALELAVRFGKTLIIQEMDGVEPVLYPLLRRDLVAQGPR
YVVQIGDKIIDYNEEFRLFLSTRNPNPFIPPDAASIVTEVNFTTTRSGLR
GQLLALTIQHEKPDLEEQKTKLLQQEEDKKIQLAKLEESLLETLATSQGN
ILENKDLIESLNQTKASSALIQESLKESYKLQISLDQERDAYLPLAESAS
KMYFIISDLSKINNMYRFSLAAFLRLFQRALQNKQDSENTEQRIQSLISS
LQHMVYEYICRCLFKADQLMFALHFVRGMHPELFQENEWDTFTGVVVGDM
LRKADSQQKIRDQLPSWIDQERSWAVATLKIALPSLYQTLCFEDAALWRT
YYNNSMCEQEFPSILAKKVSLFQQILVVQALRPDRLQSAMALFACKTLGL
KEVSPLPLNLKRLYKETLEIEPILIIISPGADPSQELQELANAERSGECY
HQVAMGQGQADLAIQMLKECARNGDWLCLKNLHLVVSWLPVLEKELNTLQ
PKDTFRLWLTAEVHPNFTPILLQSSLKITYESPPGLKKNLMRTYESWTPE
QISKKDNTHRAHALFSLAWFHAACQERRNYIPQGWTKFYEFSLSDLRAGY
NIIDRLFDGAKDVQWEFVHGLLENAIYGGRIDNYFDLRVLQSYLKQFFNS
SVIDVFNQRNKKSIFPYSVSLPQSCSILDYRAVIEKIPEDDKPSFFGLPA
NIARSSQRMISSQVISQLRILGRSITAGSKFDREIWSNELSPVLNLWKKL
NQNSNLIHQKVPPPNDRQGSPILSFIILEQFNAIRLVQSVHQSLAALSKV
IRGTTLLSSEVQKLASALLNQKCPLAWQSKWEGPEDPLQYLRGLVARALA
IQNWVDKAEKQALLSETLDLSELFHPDTFLNALRQETARAVGRSVDSLKF
VASWKGRLQEAKLQIKISGLLLEGCSFDGNQLSENQLDSPSVSSVLPCFM
GWIPQDACGPYSPDECISLPVYTSAERDRVVTNIDVPCGGNQDQWIQCGA
ALFLKNQ

Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках, війках.

Література

  • Vaisberg E.A., Grissom P.M., McIntosh J.R. (1996). Mammalian cells express three distinct dynein heavy chains that are localized to different cytoplasmic organelles. J. Cell Biol. 133: 831—842. PMID 8666668 DOI:10.1083/jcb.133.4.831
  • Gibbons B.H., Asai D.J., Tang W.-J.Y., Hays T.S., Gibbons I.R. (1994). Phylogeny and expression of axonemal and cytoplasmic dynein genes in sea urchins. Mol. Biol. Cell. 5: 57—70. PMID 8186465 DOI:10.1091/mbc.5.1.57

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з DYNC2H1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2962 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
  5. UniProt, Q8NCM8 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Людські
Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки
Міофіламенти
Актин
Міозин
Інші
Інші
Проміжні філаменти
Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)
Епітеліальні кератини
(м'які альфа-кератини)
Кератини волосся
(жорсткі альфа-кератини)
Незгруповані альфа
Не-альфа
  • Бета-кератин
Тип 3
Тип 4
Тип 5
Мікротрубочки
та пов'язані білки
Тубулін
Кінезин
Динеїн
Інші
Катеніни
Мембранні
Інші
Нелюдські