DYNC2LI1

Ідентифікатори

Символи

DYNC2LI1, D2LIC, LIC3, CGI-60, dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1

Зовнішні ІД

OMIM: 617083 MGI: 1913996 HomoloGene: 9336 GeneCards: DYNC2LI1

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• dynein heavy chain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cytoskeletal motor activity • minus-end-directed microtubule motor activity
Клітинна компонента	• intraciliary transport particle • cell projection • apical part of cell • ciliary tip • dynein complex • GO:0035085 Аксонема • cytoplasmic microtubule • мікротрубочка • цитоскелет • цитоплазма • центросома • центр організації мікротрубочок • cytoplasmic dynein complex • війка • motile cilium • ciliary transition zone • ciliary basal body
Біологічний процес	• multicellular organism development • determination of left/right symmetry • cell projection organization • intraciliary transport involved in cilium assembly • regulation of cilium assembly • intraciliary retrograde transport • cilium assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51626


213575

Ensembl


ENSG00000138036


ENSMUSG00000024253

UniProt


Q8TCX1


Q8K0T2

RefSeq (мРНК)

NM_001012665 NM_001193464 NM_015522 NM_016008 NM_001348912
NM_001348913


NM_172256

RefSeq (білок)


NP_001180393 NP_056337 NP_057092 NP_001335841 NP_001335842


NP_758460

Локус (UCSC)

Хр. 2: 43.77 – 43.81 Mb

Хр. 17: 84.93 – 84.96 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DYNC2LI1 (англ. Dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 351 амінокислот, а молекулярна маса — 39 625^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSETLWEIA	KAEVEKRGIN	GSEGDGAEIA	EKFVFFIGSK	NGGKTTIILR
CLDRDEPPKP	TLALEYTYGR	RAKGHNTPKD	IAHFWELGGG	TSLLDLISIP
ITGDTLRTFS	LVLVLDLSKP	NDLWPTMENL	LQATKSHVDK	VIMKLGKTNA
KAVSEMRQKI	WNNMPKDHPD	HELIDPFPVP	LVIIGSKYDV	FQDFESEKRK
VICKTLRFVA	HYYGASLMFT	SKSEALLLKI	RGVINQLAFG	IDKSKSICVD
QNKPLFITAG	LDSFGQIGSP	PVPENDIGKL	HAHSPMELWK	KVYEKLFPPK
SINTLKDIKD	PARDPQYAEN	EVDEMRIQKD	LELEQYKRSS	SKSWKQIELD
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література

Grissom P.M., Vaisberg E.A., McIntosh J.R. (2002). Identification of a novel light intermediate chain (D2LIC) for mammalian cytoplasmic dynein 2. Mol. Biol. Cell. 13: 817—829. PMID 11907264 DOI:10.1091/mbc.01-08-0402
Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DYNC2LI1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24595 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8TCX1 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2016. Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Білки цитоскелету

Людські

Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки

Міофіламенти

Актин	A1 A2 B C1 G1 G2

Міозин	I A B C D E F G H II 1 2 3 4 6 7 7B 8 9 10 11 13 14 15 16 III A B V A B C VI MYO6 VII A B IX A B X MYO10 XV A B XVIII A B Легкий ланцюг міозину 1 2 3 4 5 6 6B 7 9 10 12A 12B IP K K2 K3 K4 L1 PF

Інші	Тропомодулін 1 2 3 4 Тропонін T 1 2 3 C 1 2 I 1 2 3 Тропоміозин 1 2 3 4 Актинін 1 2 3 4 Комплекс Arp2/3 актин-деполімеризуючі фактори Кофілін 1 2 дестрин Гелсолін Профілін 1 2 Тітин

Інші

WAS
Фібрилін
Філамін
- A
- B
- C
Еспін
TRIOBP

Проміжні філаменти

Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)

Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 10 12 13 14 15 16 17 19 20 хромосома 12 18 інші 21 тип II/хромосома 12 1 2 3 4 5 6A 6B 7 8 9

Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 31 32 33A 33B 34 35 36 37 38 тип II/хромосома 12 81 82 83 84 85 86

Незгруповані альфа	хромосома 17 23 24 25 26 27 28 39 40 хромосома 12 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80

Не-альфа	Бета-кератин

Тип 3

Тип 4

Інтернексин
Нестин
Нейрофіламент
- NEFL
- NEFM
- NEFH
Синемін
Синкоїлін

Тип 5

Ламіни: A/C
B1
B2

Мікротрубочки
та пов'язані білки

Тубулін	1A 1B 1C 3C 3D 3E 4A 8

Кінезин	1A 1B 2A 2C 3B 3C 4A 4B 5A 5B 5C 6 7 9 11 12 13A 13B 14 15 16B 17 18A 18B 19 20A 20B 21A 21B 22 23 24 25 26A 26B 27 C1 C2 C3

Динеїн	аксонемні: 1 2 3 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 17 I1 I2 LI1 L1 L4 цитоплазматичні: C1H1 C2H1 C1I1 C1I2 C1LI1 C1LI2 C2LI1 LL1 LL2 LRB1 LRB2 LT1 LT3

Інші	MAPT DCTN1 STMN1 Тектин 1 2 3 4 5 Динамін 1 2 3