Профілін-1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1AWI, 1CF0, 1CJF, 1FIK, 1FIL, 1PFL, 2PAV, 2PBD, 3CHW, 4X1L, 4X1M, 4X25

Ідентифікатори

Символи

PFN1, ALS18, Profilin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 176610 MGI: 97549 HomoloGene: 3684 GeneCards: PFN1

Пов'язані генетичні захворювання

amyotrophic lateral sclerosis type 18^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin monomer binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • adenyl-nucleotide exchange factor activity • actin binding • proline-rich region binding • RNA binding • cadherin binding • signaling receptor binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • blood microparticle • мембрана • focal adhesion • cell cortex • екзосома • цитоскелет • цитоплазма • клітинне ядро • міжклітинний простір • neuron projection • синапс • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• positive regulation of actin filament polymerization • positive regulation of ATP-dependent activity • negative regulation of actin filament polymerization • positive regulation of ruffle assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • protein stabilization • positive regulation of epithelial cell migration • negative regulation of actin filament bundle assembly • neural tube closure • positive regulation of actin filament bundle assembly • negative regulation of stress fiber assembly • actin cytoskeleton organization • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • response to organic substance • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of viral transcription • positive regulation of DNA metabolic process • positive regulation of stress fiber assembly • cellular response to growth factor stimulus • regulation of actin filament polymerization • synapse maturation • modification of postsynaptic actin cytoskeleton
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5216


18643

Ensembl


ENSG00000108518


ENSMUSG00000018293

UniProt


P07737


P62962

RefSeq (мРНК)


NM_005022 NM_001375991


NM_011072

RefSeq (білок)


NP_005013 NP_001362920


NP_035202

Локус (UCSC)

Хр. 17: 4.95 – 4.95 Mb

Хр. 11: 70.54 – 70.55 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Профілін-1 (англ. Profilin 1) – білок, який кодується геном PFN1, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 140 амінокислот, а молекулярна маса — 15 054^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGWNAYIDN	LMADGTCQDA	AIVGYKDSPS	VWAAVPGKTF	VNITPAEVGV
LVGKDRSSFY	VNGLTLGGQK	CSVIRDSLLQ	DGEFSMDLRT	KSTGGAPTFN
VTVTKTDKTL	VLLMGKEGVH	GGLINKKCYE	MASHLRRSQY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ampe C., Markey F., Lindberg U., Vandekerckhove J. (1988). The primary structure of human platelet profilin: reinvestigation of the calf spleen profilin sequence. FEBS Lett. 228: 17—21. PMID 3342873 DOI:10.1016/0014-5793(88)80575-1
Gieselmann R., Kwiatkowski D.J., Janmey P.A., Witke W. (1995). Distinct biochemical characteristics of the two human profilin isoforms. Eur. J. Biochem. 229: 621—628. PMID 7758455 DOI:10.1111/j.1432-1033.1995.tb20506.x
Stueven T., Hartmann E., Goerlich D. (2003). Exportin 6: a novel nuclear export receptor that is specific for profilin.actin complexes. EMBO J. 22: 5928—5940. PMID 14592989 DOI:10.1093/emboj/cdg565
Shao J., Welch W.J., Diprospero N.A., Diamond M.I. (2008). Phosphorylation of profilin by ROCK1 regulates polyglutamine aggregation. Mol. Cell. Biol. 28: 5196—5208. PMID 18573880 DOI:10.1128/MCB.00079-08
Mahoney N.M., Janmey P.A., Almo S.C. (1997). Structure of the profilin-poly-L-proline complex involved in morphogenesis and cytoskeletal regulation. Nat. Struct. Biol. 4: 953—960. PMID 9360613 DOI:10.1038/nsb1197-953

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з Профілін-1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8881 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
↑ UniProt, P07737 (англ.) . Архів оригіналу за 1 січня 2017. Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Білки цитоскелету

Людські

Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки

Міофіламенти

Актин	A1 A2 B C1 G1 G2

Міозин	I A B C D E F G H II 1 2 3 4 6 7 7B 8 9 10 11 13 14 15 16 III A B V A B C VI MYO6 VII A B IX A B X MYO10 XV A B XVIII A B Легкий ланцюг міозину 1 2 3 4 5 6 6B 7 9 10 12A 12B IP K K2 K3 K4 L1 PF

Інші	Тропомодулін 1 2 3 4 Тропонін T 1 2 3 C 1 2 I 1 2 3 Тропоміозин 1 2 3 4 Актинін 1 2 3 4 Комплекс Arp2/3 актин-деполімеризуючі фактори Кофілін 1 2 дестрин Гелсолін Профілін 1 2 Тітин

Інші

WAS
Фібрилін
Філамін
- A
- B
- C
Еспін
TRIOBP

Проміжні філаменти

Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)

Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 10 12 13 14 15 16 17 19 20 хромосома 12 18 інші 21 тип II/хромосома 12 1 2 3 4 5 6A 6B 7 8 9

Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 31 32 33A 33B 34 35 36 37 38 тип II/хромосома 12 81 82 83 84 85 86

Незгруповані альфа	хромосома 17 23 24 25 26 27 28 39 40 хромосома 12 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80

Не-альфа	Бета-кератин

Тип 3

Тип 4

Інтернексин
Нестин
Нейрофіламент
- NEFL
- NEFM
- NEFH
Синемін
Синкоїлін

Тип 5

Ламіни: A/C
B1
B2

Мікротрубочки
та пов'язані білки

Тубулін	1A 1B 1C 3C 3D 3E 4A 8

Кінезин	1A 1B 2A 2C 3B 3C 4A 4B 5A 5B 5C 6 7 9 11 12 13A 13B 14 15 16B 17 18A 18B 19 20A 20B 21A 21B 22 23 24 25 26A 26B 27 C1 C2 C3

Динеїн	аксонемні: 1 2 3 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 17 I1 I2 LI1 L1 L4 цитоплазматичні: C1H1 C2H1 C1I1 C1I2 C1LI1 C1LI2 C2LI1 LL1 LL2 LRB1 LRB2 LT1 LT3

Інші	MAPT DCTN1 STMN1 Тектин 1 2 3 4 5 Динамін 1 2 3