HCN1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HCN1, BCNG-1, BCNG1, EIEE24, HAC-2, hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, GEFSP10, DEE24 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602780 MGI: 1096392 HomoloGene: 32093 GeneCards: HCN1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
undetermined early-onset epileptic encephalopathy, generalized epilepsy with febrile seizures plus[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
івабрадин[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • intracellular cAMP-activated cation channel activity • identical protein binding • voltage-gated sodium channel activity • ion channel activity • potassium channel activity • sodium channel activity • voltage-gated ion channel activity • voltage-gated potassium channel activity • voltage-gated cation channel activity • cAMP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • аксон • мембрана • дендрит (нейробіологія) • клітинна мембрана • integral component of membrane • HCN channel complex • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • трансмембранний транспорт • retinal cone cell development • regulation of ion transmembrane transport • apical protein localization • ion transport • sodium ion transport • regulation of membrane potential • sodium ion transmembrane transport • potassium ion transmembrane transport • potassium ion transport • protein homotetramerization • cellular response to cAMP |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 45.25 – 45.7 Mb | Хр. 13: 117.74 – 118.12 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HCN1 (англ. Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 890 амінокислот, а молекулярна маса — 98 796[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEGGGKPNSS | | SNSRDDGNSV | | FPAKASATGA | | GPAAAEKRLG | | TPPGGGGAGA |
KEHGNSVCFK | | VDGGGGGGGG | | GGGGEEPAGG | | FEDAEGPRRQ | | YGFMQRQFTS |
MLQPGVNKFS | | LRMFGSQKAV | | EKEQERVKTA | | GFWIIHPYSD | | FRFYWDLIML |
IMMVGNLVII | | PVGITFFTEQ | | TTTPWIIFNV | | ASDTVFLLDL | | IMNFRTGTVN |
EDSSEIILDP | | KVIKMNYLKS | | WFVVDFISSI | | PVDYIFLIVE | | KGMDSEVYKT |
ARALRIVRFT | | KILSLLRLLR | | LSRLIRYIHQ | | WEEIFHMTYD | | LASAVVRIFN |
LIGMMLLLCH | | WDGCLQFLVP | | LLQDFPPDCW | | VSLNEMVNDS | | WGKQYSYALF |
KAMSHMLCIG | | YGAQAPVSMS | | DLWITMLSMI | | VGATCYAMFV | | GHATALIQSL |
DSSRRQYQEK | | YKQVEQYMSF | | HKLPADMRQK | | IHDYYEHRYQ | | GKIFDEENIL |
NELNDPLREE | | IVNFNCRKLV | | ATMPLFANAD | | PNFVTAMLSK | | LRFEVFQPGD |
YIIREGAVGK | | KMYFIQHGVA | | GVITKSSKEM | | KLTDGSYFGE | | ICLLTKGRRT |
ASVRADTYCR | | LYSLSVDNFN | | EVLEEYPMMR | | RAFETVAIDR | | LDRIGKKNSI |
LLQKFQKDLN | | TGVFNNQENE | | ILKQIVKHDR | | EMVQAIAPIN | | YPQMTTLNST |
SSTTTPTSRM | | RTQSPPVYTA | | TSLSHSNLHS | | PSPSTQTPQP | | SAILSPCSYT |
TAVCSPPVQS | | PLAARTFHYA | | SPTASQLSLM | | QQQPQQQVQQ | | SQPPQTQPQQ |
PSPQPQTPGS | | STPKNEVHKS | | TQALHNTNLT | | REVRPLSASQ | | PSLPHEVSTL |
ISRPHPTVGE | | SLASIPQPVT | | AVPGTGLQAG | | GRSTVPQRVT | | LFRQMSSGAI |
PPNRGVPPAP | | PPPAAALPRE | | SSSVLNTDPD | | AEKPRFASNL |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, транспорт натрію. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, калію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Lee C.H., MacKinnon R. (2017). Structures of the human HCN1 hyperpolarization-activated channel. Cell. 168: 111—120. PMID 28086084 DOI:10.1016/j.cell.2016.12.023
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з HCN1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4845 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O60741 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|