TRPC1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPC1, HTRP-1, TRP1, transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602343 MGI: 109528 HomoloGene: 2478 GeneCards: TRPC1 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
2-aminoethoxydiphenylborate[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • store-operated calcium channel activity • transmembrane transporter binding • calcium channel activity • inositol 1,4,5 trisphosphate binding • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cation channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • receptor complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • cation channel complex |
---|
Біологічний процес | • melanin biosynthetic process • regulation of cardiac conduction • regulation of cytosolic calcium ion concentration • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol • ion transport • response to calcium ion • calcium ion transmembrane transport • manganese ion transport • calcium ion transport • трансмембранний транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 142.72 – 142.81 Mb | Хр. 9: 95.59 – 95.63 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPC1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 793 амінокислот, а молекулярна маса — 91 212[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMAALYPSTD | | LSGASSSSLP | | SSPSSSSPNE | | VMALKDVREV | | KEENTLNEKL |
FLLACDKGDY | | YMVKKILEEN | | SSGDLNINCV | | DVLGRNAVTI | | TIENENLDIL |
QLLLDYGCQS | | ADALLVAIDS | | EVVGAVDILL | | NHRPKRSSRP | | TIVKLMERIQ |
NPEYSTTMDV | | APVILAAHRN | | NYEILTMLLK | | QDVSLPKPHA | | VGCECTLCSA |
KNKKDSLRHS | | RFRLDIYRCL | | ASPALIMLTE | | EDPILRAFEL | | SADLKELSLV |
EVEFRNDYEE | | LARQCKMFAK | | DLLAQARNSR | | ELEVILNHTS | | SDEPLDKRGL |
LEERMNLSRL | | KLAIKYNQKE | | FVSQSNCQQF | | LNTVWFGQMS | | GYRRKPTCKK |
IMTVLTVGIF | | WPVLSLCYLI | | APKSQFGRII | | HTPFMKFIIH | | GASYFTFLLL |
LNLYSLVYNE | | DKKNTMGPAL | | ERIDYLLILW | | IIGMIWSDIK | | RLWYEGLEDF |
LEESRNQLSF | | VMNSLYLATF | | ALKVVAHNKF | | HDFADRKDWD | | AFHPTLVAEG |
LFAFANVLSY | | LRLFFMYTTS | | SILGPLQISM | | GQMLQDFGKF | | LGMFLLVLFS |
FTIGLTQLYD | | KGYTSKEQKD | | CVGIFCEQQS | | NDTFHSFIGT | | CFALFWYIFS |
LAHVAIFVTR | | FSYGEELQSF | | VGAVIVGTYN | | VVVVIVLTKL | | LVAMLHKSFQ |
LIANHEDKEW | | KFARAKLWLS | | YFDDKCTLPP | | PFNIIPSPKT | | ICYMISSLSK |
WICSHTSKGK | | VKRQNSLKEW | | RNLKQKRDEN | | YQKVMCCLVH | | RYLTSMRQKM |
QSTDQATVEN | | LNELRQDLSK | | FRNEIRDLLG | | FRTSKYAMFY | | PRN |
Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.
Література
- Zhu X., Chu P.B., Peyton M., Birnbaumer L. (1995). Molecular cloning of a widely expressed human homologue for the Drosophila trp gene. FEBS Lett. 373: 193—198. PMID 7589464 DOI:10.1016/0014-5793(95)01038-G
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Xu S.-Z., Beech D.J. (2001). TrpC1 is a membrane-spanning subunit of store-operated Ca(2+) channels in native vascular smooth muscle cells. Circ. Res. 88: 84—87. PMID 11139478 DOI:10.1161/01.RES.88.1.84
- Hofmann T., Schaefer M., Schultz G., Gudermann T. (2002). Subunit composition of mammalian transient receptor potential channels in living cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7461—7466. PMID 12032305 DOI:10.1073/pnas.102596199
- Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12333 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P48995 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|