TRPC3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPC3, SCA41, TRP3, transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602345 MGI: 109526 HomoloGene: 20708 GeneCards: TRPC3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
spinocerebellar ataxia type 41[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
2-aminoethoxydiphenylborate[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • store-operated calcium channel activity • calcium channel activity • inositol 1,4,5 trisphosphate binding • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • cation channel complex |
---|
Біологічний процес | • response to ATP • positive regulation of calcium ion transport into cytosol • ion transport • single fertilization • platelet activation • response to calcium ion • calcium ion transmembrane transport • positive regulation of cardiac muscle hypertrophy in response to stress • manganese ion transport • calcium ion transport • phototransduction • трансмембранний транспорт • regulation of cytosolic calcium ion concentration |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001130698 NM_003305 NM_001366479 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001124170 NP_003296 NP_001353408 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 121.87 – 121.95 Mb | Хр. 3: 36.67 – 36.74 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPC3 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 836 амінокислот, а молекулярна маса — 96 009[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MREKGRRQAV | | RGPAFMFNDR | | GTSLTAEEER | | FLDAAEYGNI | | PVVRKMLEES |
KTLNVNCVDY | | MGQNALQLAV | | GNEHLEVTEL | | LLKKENLARI | | GDALLLAISK |
GYVRIVEAIL | | NHPGFAASKR | | LTLSPCEQEL | | QDDDFYAYDE | | DGTRFSPDIT |
PIILAAHCQK | | YEVVHMLLMK | | GARIERPHDY | | FCKCGDCMEK | | QRHDSFSHSR |
SRINAYKGLA | | SPAYLSLSSE | | DPVLTALELS | | NELAKLANIE | | KEFKNDYRKL |
SMQCKDFVVG | | VLDLCRDSEE | | VEAILNGDLE | | SAEPLEVHRH | | KASLSRVKLA |
IKYEVKKFVA | | HPNCQQQLLT | | IWYENLSGLR | | EQTIAIKCLV | | VLVVALGLPF |
LAIGYWIAPC | | SRLGKILRSP | | FMKFVAHAAS | | FIIFLGLLVF | | NASDRFEGIT |
TLPNITVTDY | | PKQIFRVKTT | | QFTWTEMLIM | | VWVLGMMWSE | | CKELWLEGPR |
EYILQLWNVL | | DFGMLSIFIA | | AFTARFLAFL | | QATKAQQYVD | | SYVQESDLSE |
VTLPPEIQYF | | TYARDKWLPS | | DPQIISEGLY | | AIAVVLSFSR | | IAYILPANES |
FGPLQISLGR | | TVKDIFKFMV | | LFIMVFFAFM | | IGMFILYSYY | | LGAKVNAAFT |
TVEESFKTLF | | WSIFGLSEVT | | SVVLKYDHKF | | IENIGYVLYG | | IYNVTMVVVL |
LNMLIAMINS | | SYQEIEDDSD | | VEWKFARSKL | | WLSYFDDGKT | | LPPPFSLVPS |
PKSFVYFIMR | | IVNFPKCRRR | | RLQKDIEMGM | | GNSKSRLNLF | | TQSNSRVFES |
HSFNSILNQP | | TRYQQIMKRL | | IKRYVLKAQV | | DKENDEVNEG | | ELKEIKQDIS |
SLRYELLEDK | | SQATEELAIL | | IHKLSEKLNP | | SMLRCE |
Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.
Література
- Xu X.-Z.S., Li H.-S., Guggino W.B., Montell C. (1997). Coassembly of TRP and TRPL produces a distinct store-operated conductance. Cell. 89: 1155—1164. PMID 9215637 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80302-5
- Yildirim E., Kawasaki B.T., Birnbaumer L. (2005). Molecular cloning of TRPC3a, an N-terminally extended, store-operated variant of the human C3 transient receptor potential channel. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 3307—3311. PMID 15728370 DOI:10.1073/pnas.0409908102
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Vannier B., Zhu X., Brown D., Birnbaumer L. (1998). The membrane topology of human transient receptor potential 3 as inferred from glycosylation-scanning mutagenesis and epitope immunocytochemistry. J. Biol. Chem. 273: 8675—8679. PMID 9535843 DOI:10.1074/jbc.273.15.8675
- Zhu X., Jiang M., Birnbaumer L. (1998). Receptor-activated Ca2+ influx via human Trp3 stably expressed in human embryonic kidney (HEK)293 cells. Evidence for a non-capacitative Ca2+ entry. J. Biol. Chem. 273: 133—142. PMID 9417057 DOI:10.1074/jbc.273.1.133
- Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPC3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12335 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q13507 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|