VDAC1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2JK4, 2K4T | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | VDAC1, PORIN, VDAC-1, voltage dependent anion channel 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604492 MGI: 106919 HomoloGene: 107244 GeneCards: VDAC1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • porin activity • transmembrane transporter binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • anion channel activity • voltage-gated anion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • Синаптичні бульбашки • myelin sheath • клітинна мембрана • мітохондріальна зовнішня мембрана • мітохондрія • мітохондріальна внутрішня мембрана • membrane raft • mitochondrial nucleoid • екзосома • pore complex • клітинне ядро • mitochondrial permeability transition pore complex • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • chemical synaptic transmission • epithelial cell differentiation • mitochondrial calcium ion transmembrane transport • neuron-neuron synaptic transmission • ion transport • навчення • anion transport • behavioral fear response • anion transmembrane transport • regulation of autophagy of mitochondrion • трансмембранний транспорт • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process • GO:0022415 viral process • macroautophagy • GO:0097285 апоптоз • regulation of anion transmembrane transport • GO:0015915 транспорт • pyruvate metabolic process • inorganic anion transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | NP_035824 NP_001349622 NP_001387915 NP_001387916 NP_001387917
| NP_001387918 |
|
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 11: 52.36 – 52.39 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VDAC1 (англ. Voltage dependent anion channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 283 амінокислот, а молекулярна маса — 30 773[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAVPPTYADL | | GKSARDVFTK | | GYGFGLIKLD | | LKTKSENGLE | | FTSSGSANTE |
TTKVTGSLET | | KYRWTEYGLT | | FTEKWNTDNT | | LGTEITVEDQ | | LARGLKLTFD |
SSFSPNTGKK | | NAKIKTGYKR | | EHINLGCDMD | | FDIAGPSIRG | | ALVLGYEGWL |
AGYQMNFETA | | KSRVTQSNFA | | VGYKTDEFQL | | HTNVNDGTEF | | GGSIYQKVNK |
KLETAVNLAW | | TAGNSNTRFG | | IAAKYQIDPD | | ACFSAKVNNS | | SLIGLGYTQT |
LKPGIKLTLS | | ALLDGKNVNA | | GGHKLGLGLE | | FQA |
Кодований геном білок за функцією належить до поринів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.
Література
- Decker W.K., Bowles K.R., Schatte E.C., Towbin J.A., Craigen W.J. (1999). Revised fine mapping of the human voltage-dependent anion channel loci by radiation hybrid analysis. Mamm. Genome. 10: 1041—1042. PMID 10501981 DOI:10.1007/s003359901158
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Thomas L., Blachly-Dyson E., Colombini M., Forte M.A. (1993). Mapping of residues forming the voltage sensor of the voltage-dependent anion-selective channel. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 5446—5449. PMID 7685903 DOI:10.1073/pnas.90.12.5446
- Yu W.H., Wolfgang W., Forte M.A. (1995). Subcellular localization of human voltage-dependent anion channel isoforms. J. Biol. Chem. 270: 13998—14006. PMID 7539795 DOI:10.1074/jbc.270.23.13998
- Verrier F., Mignotte B., Jan G., Brenner C. (2003). Study of PTPC composition during apoptosis for identification of viral protein target. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1010: 126—142. PMID 15033708 DOI:10.1196/annals.1299.022
- Zamarin D., Garcia-Sastre A., Xiao X., Wang R., Palese P. (2005). Influenza virus PB1-F2 protein induces cell death through mitochondrial ANT3 and VDAC1. PLoS Pathog. 1: 40—54. PMID 16201016 DOI:10.1371/journal.ppat.0010004
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12669 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P21796 (англ.) . Архів оригіналу за 6 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|